我校创办于1907年（清光绪三十三年春），是一所百年老校。百年栉风沐雨，学校名师云集，桃李满天下，中国土壤学奠基人侯光炯、中国大地测绘学奠基人叶雪安等，都曾在本校就读。1997年5月，校名更改为金山区吕巷中心小学，2004年9月中心校校舍扩建翻修后，校名更改为金山区吕巷小学。 学校现占地面积12283m2，建筑面积2，现有教学班15个，教职员工61人。2008年被评为上海市花园单位。近年来，连续被评为金山区文明单位。2017年被评为上海市中小学生行为规范示范校，上海市书法教育实验校（示范校）。